220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0548 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0548  acetyltransferase  100 
 
 
186 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0544  hypothetical protein  47.85 
 
 
201 aa  177  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2997  acetyltransferase-like protein  38.32 
 
 
218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3568  acetyltransferase-like protein  36.08 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0805  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  28.57 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  29.52 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  24.53 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  26.25 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000873  putative acetyltransferase  24.83 
 
 
171 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  24.53 
 
 
171 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0920408  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
178 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  25.81 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  30.77 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  25.15 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  24.83 
 
 
170 aa  55.1  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  25.77 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  27.27 
 
 
195 aa  55.1  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
178 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
178 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  24.69 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.92 
 
 
380 aa  53.9  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  23.37 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30 
 
 
359 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  24.34 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  23.72 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0271  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.75 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1448  GCN5-related N-acetyltransferase  21.94 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  24.36 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
181 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  23.98 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  22.83 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 
168 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.53 
 
 
168 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  26.22 
 
 
178 aa  51.6  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4734  acetytransferase  27.71 
 
 
173 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  23.49 
 
 
177 aa  51.6  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3988  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
197 aa  51.2  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5169  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  26.51 
 
 
173 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  24.86 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  22.28 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  21.79 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  26.25 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  31.5 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  29.77 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5164  acetyltransferase, putative  25.9 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5179  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.31 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4498  acetyltransferase, GNAT family  29.77 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  28.03 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
195 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4098  acetyltransferase  29.77 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4109  acetyltransferase  29.77 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  26.14 
 
 
601 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4593  acetyltransferase  29.77 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0478  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4445  acetyltransferase, GNAT family  29.77 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  21.79 
 
 
178 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  30.43 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  21.34 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 
171 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
185 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 
188 aa  48.5  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  23.12 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.81 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13328  acetyltransferase, GNAT family protein  25.31 
 
 
169 aa  48.9  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248311  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3405  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
194 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000780456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  22.45 
 
 
183 aa  48.9  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.152334  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3353  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
181 aa  48.9  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000080  putative acetyltransferase  25 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  23.12 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  26.54 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
189 aa  48.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  25.48 
 
 
185 aa  47.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  23.12 
 
 
186 aa  47.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
192 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  24.53 
 
 
183 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  24.53 
 
 
183 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  23.86 
 
 
184 aa  47.8  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  23.6 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.321693  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  29.81 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
194 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324183  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
175 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2355  GCN5-related N-acetyltransferase  23.66 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382681  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0553  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  23.57 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>