90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0805 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0805  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
171 aa  352  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3568  acetyltransferase-like protein  35.17 
 
 
195 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2997  acetyltransferase-like protein  33.77 
 
 
218 aa  87.8  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0544  hypothetical protein  28.21 
 
 
201 aa  77  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0548  acetyltransferase  26.92 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
169 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
182 aa  60.8  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0786  acetyltransferase  26.38 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  26.01 
 
 
179 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
189 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00124051  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.47 
 
 
380 aa  54.7  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
175 aa  51.6  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  24.66 
 
 
179 aa  50.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 
171 aa  50.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.988966  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  20.69 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
193 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  27.33 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.17 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1741  GCN5-related N-acetyltransferase  25.14 
 
 
184 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0937036  normal  0.375593 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
173 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
183 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
196 aa  48.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
186 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  26.17 
 
 
180 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  27.21 
 
 
179 aa  47.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  26.17 
 
 
180 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  26.17 
 
 
180 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1764  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2015  hypothetical protein  25.68 
 
 
182 aa  47.8  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0137581  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  22.49 
 
 
359 aa  47.4  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  26.17 
 
 
180 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1041  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
200 aa  47.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0696041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  26.17 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
180 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.17 
 
 
180 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  26.53 
 
 
184 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  24.31 
 
 
175 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  26.17 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0253  acetyltransferase  23.84 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.146239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
208 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  26.88 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000873  putative acetyltransferase  25 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
188 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
214 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
195 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  25.79 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002738  acetyltransferase  23.65 
 
 
237 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000969588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3740  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.84 
 
 
186 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
202 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
193 aa  44.3  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2075  hypothetical protein  26.35 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4677  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121511  normal  0.198748 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  24.05 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3047  GCN5-related N-acetyltransferase  22.75 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0386186  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  25.5 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2167  hypothetical protein  26.35 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.670672  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
207 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  22.54 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  25.26 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.113437  decreased coverage  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05830  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.59 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0377  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  23.81 
 
 
221 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  23.97 
 
 
189 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.684  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
205 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
185 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
207 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0906  GCN5-related protein N-acetyltransferase  32 
 
 
197 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4451  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
196 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0299  N-acetyltransferase  30.86 
 
 
164 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.219282  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
171 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1730  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
181 aa  41.6  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.170022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  18.88 
 
 
185 aa  41.6  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  25.35 
 
 
185 aa  41.6  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2640  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
184 aa  41.6  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2946  acetyltransferase, GNAT family  29.87 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000111419  decreased coverage  0.00000000013504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2385  acetyltransferase, GNAT family  29.87 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000643226  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4036  GCN5-related N-acetyltransferase  24.05 
 
 
210 aa  41.2  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357695  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7134  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
174 aa  41.2  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05693  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.32 
 
 
169 aa  41.2  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0068  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 
166 aa  40.8  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.667629  hitchhiker  0.000592502 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1537  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  24.52 
 
 
195 aa  40.8  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0079  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  22.75 
 
 
173 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3988  GCN5-related N-acetyltransferase  23.56 
 
 
197 aa  40.8  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>