80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1516 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  100 
 
 		 552 aa  1069    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  42.49 
 
 		 627 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  47.66 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  28.97 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  31.93 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  28.12 
 
 		 498 aa  98.2  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  31.71 
 
 		 503 aa  94  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  29.72 
 
 		 453 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  28.02 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  27.22 
 
 		 483 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  32.79 
 
 		 502 aa  90.1  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  29.33 
 
 		 481 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  30.91 
 
 		 564 aa  88.2  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  31.78 
 
 		 502 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  27.82 
 
 		 481 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  31.49 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  30.81 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  32.37 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  31.23 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0034  hypothetical protein  33.46 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  30.43 
 
 		 496 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  31.43 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  31.43 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  31.43 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  29.19 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  29.33 
 
 		 578 aa  67  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  27.07 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  34.62 
 
 		 144 aa  65.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  28.16 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  34.74 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  33.81 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  34.65 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  36.75 
 
 		 157 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  26.88 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  38.6 
 
 		 482 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  33.73 
 
 		 281 aa  54.7  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  43.42 
 
 		 139 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  43.42 
 
 		 139 aa  53.9  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  31.09 
 
 		 177 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  43.42 
 
 		 139 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  36.75 
 
 		 157 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  33.33 
 
 		 151 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  42.11 
 
 		 139 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  42.11 
 
 		 139 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  33.33 
 
 		 151 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  33.33 
 
 		 151 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  33.33 
 
 		 151 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  33.33 
 
 		 160 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  33.33 
 
 		 160 aa  52  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  33.33 
 
 		 160 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  34.78 
 
 		 151 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  35.04 
 
 		 157 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  40.79 
 
 		 142 aa  50.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  36.36 
 
 		 156 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  38.3 
 
 		 139 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  33.93 
 
 		 183 aa  50.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  38.3 
 
 		 139 aa  50.4  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  38.14 
 
 		 139 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  34.78 
 
 		 170 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  32.46 
 
 		 151 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  37.61 
 
 		 154 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  32.46 
 
 		 151 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  32.46 
 
 		 151 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  32.46 
 
 		 151 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  34.95 
 
 		 151 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  36.15 
 
 		 183 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  35.14 
 
 		 144 aa  47.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  38.04 
 
 		 139 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  36 
 
 		 143 aa  47.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0006  hypothetical protein  36.7 
 
 		 144 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  28.37 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  31.08 
 
 		 241 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1877  Curlin associated repeat protein  28.2 
 
 		 441 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01039  cryptic curlin major subunit  29.32 
 
 		 151 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2603  cryptic curlin major subunit  29.32 
 
 		 151 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.761097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01046  hypothetical protein  29.32 
 
 		 151 aa  43.5  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2557  cryptic curlin major subunit  29.32 
 
 		 151 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1161  cryptic curlin major subunit  29.32 
 
 		 151 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.401607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1162  cryptic curlin major subunit  29.32 
 
 		 151 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.596928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>