67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1725 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  100 
 
 		 183 aa  360  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  46.5 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  40.13 
 
 		 178 aa  104  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  41.4 
 
 		 177 aa  97.4  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  36.69 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  38.67 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  37.58 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  38.36 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  33.99 
 
 		 502 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  37.16 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  35.94 
 
 		 496 aa  58.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  34.81 
 
 		 496 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  34.64 
 
 		 502 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  34.64 
 
 		 502 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  34.81 
 
 		 496 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  34.81 
 
 		 496 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  34.81 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2589  hypothetical protein  33.57 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  32.33 
 
 		 245 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  39.05 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  40 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  42.05 
 
 		 139 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  36.75 
 
 		 578 aa  51.2  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  36.3 
 
 		 627 aa  50.8  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  33.93 
 
 		 552 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  39.05 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  35.71 
 
 		 498 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  39.05 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  34.51 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  34.78 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  34.51 
 
 		 500 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  31.21 
 
 		 481 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  32.81 
 
 		 481 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  25 
 
 		 453 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  35.71 
 
 		 139 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  39.13 
 
 		 144 aa  47.8  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  31.87 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  35.11 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  34.33 
 
 		 483 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  34.69 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  35.11 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  33.04 
 
 		 498 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  29.09 
 
 		 281 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  32.39 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  35.79 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  35.11 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  35.11 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  35.11 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  35.51 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  35.09 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  34.62 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  34.62 
 
 		 151 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  34.62 
 
 		 151 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  34.62 
 
 		 151 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  34.62 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  34.62 
 
 		 151 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  34.62 
 
 		 151 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  32.79 
 
 		 503 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  32.41 
 
 		 457 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  32.53 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  32.56 
 
 		 434 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0006  hypothetical protein  37.37 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  32.5 
 
 		 451 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  29.11 
 
 		 415 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  28.1 
 
 		 482 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  35.2 
 
 		 517 aa  41.6  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2730  putative minor curlin subunit precursor (fimbrin sef17 minor subunit)  29.09 
 
 		 169 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>