66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3412 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  100 
 
 		 139 aa  268  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  99.28 
 
 		 139 aa  267  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  92.5 
 
 		 139 aa  216  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  78.42 
 
 		 139 aa  215  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  76.98 
 
 		 139 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  76.98 
 
 		 139 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  76.98 
 
 		 139 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  78.42 
 
 		 139 aa  205  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  59.86 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  55.4 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  54.17 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  59.5 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  39.52 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  40.95 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  40.95 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  40.95 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  34.21 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  41.9 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  32.17 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  42.86 
 
 		 496 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  42.86 
 
 		 496 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  42.86 
 
 		 496 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  36.36 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  42.86 
 
 		 496 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  30.84 
 
 		 502 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  32.43 
 
 		 177 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  38.3 
 
 		 552 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  31.43 
 
 		 502 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  31.43 
 
 		 502 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  30.53 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  34.78 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  29.73 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  30.53 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  30.53 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  30.53 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  32.35 
 
 		 503 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  30.53 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  43.08 
 
 		 453 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  33.68 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  33.68 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  33.68 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  33.68 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  33.68 
 
 		 151 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  38.57 
 
 		 496 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  33.68 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  33.68 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  32.71 
 
 		 151 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  33 
 
 		 500 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  34.88 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01502  minor curlin subunit CsgB, putative  36.89 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  37.14 
 
 		 392 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2589  hypothetical protein  40.78 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  38.55 
 
 		 517 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  35.85 
 
 		 578 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  29.2 
 
 		 483 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  37.78 
 
 		 564 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2730  putative minor curlin subunit precursor (fimbrin sef17 minor subunit)  37.89 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  38.96 
 
 		 434 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  29.45 
 
 		 498 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  34.65 
 
 		 483 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  34.65 
 
 		 482 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  45.45 
 
 		 481 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  42.03 
 
 		 444 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  34.41 
 
 		 498 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1274  hypothetical protein  35.63 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  32.94 
 
 		 281 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>