49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3413 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  89.24 
 
 		 502 aa  862    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  80.68 
 
 		 496 aa  764    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  80.88 
 
 		 496 aa  765    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  78.09 
 
 		 496 aa  759    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  79.68 
 
 		 496 aa  768    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  100 
 
 		 502 aa  971    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  80.88 
 
 		 496 aa  766    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  98.8 
 
 		 502 aa  958    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  55.51 
 
 		 503 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  57.06 
 
 		 500 aa  511  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  55.67 
 
 		 498 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  41.65 
 
 		 451 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  35.57 
 
 		 483 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  32.79 
 
 		 552 aa  90.1  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  28.61 
 
 		 627 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  28.68 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  27.79 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  27.19 
 
 		 517 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  36.36 
 
 		 170 aa  67  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  29.86 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  26.33 
 
 		 498 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  26.75 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  29.17 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  29.9 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  34.64 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  29.26 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  25.86 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  28 
 
 		 241 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  38.2 
 
 		 144 aa  54.7  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  28.24 
 
 		 483 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  31.43 
 
 		 144 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  32.38 
 
 		 139 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  31.43 
 
 		 139 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  33.33 
 
 		 139 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  31.43 
 
 		 139 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  28.57 
 
 		 139 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  36.05 
 
 		 139 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  36.05 
 
 		 139 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  38.78 
 
 		 142 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  33.33 
 
 		 139 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  28.91 
 
 		 190 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  30.83 
 
 		 183 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  30.51 
 
 		 154 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  31.21 
 
 		 564 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  33.9 
 
 		 143 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0032  hypothetical protein  27.48 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0801235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1274  hypothetical protein  36.45 
 
 		 163 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  28.08 
 
 		 578 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  29.24 
 
 		 482 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>