55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0376 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  100 
 
 		 564 aa  1081    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  29.04 
 
 		 627 aa  89.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  27.59 
 
 		 498 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  30.91 
 
 		 552 aa  88.2  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  27.4 
 
 		 483 aa  87  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  27.69 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  28.38 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  28.52 
 
 		 517 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  27.61 
 
 		 503 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  26.94 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  30.31 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  30.3 
 
 		 392 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  30.65 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  27.96 
 
 		 500 aa  54.7  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0034  hypothetical protein  28.18 
 
 		 400 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  37.04 
 
 		 151 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  37.04 
 
 		 151 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  37.04 
 
 		 151 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  37.04 
 
 		 151 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  26.77 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  37.04 
 
 		 151 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  28.9 
 
 		 496 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  37.04 
 
 		 160 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  37.04 
 
 		 160 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  31.47 
 
 		 578 aa  51.6  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  35.19 
 
 		 151 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  35.19 
 
 		 151 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  35.19 
 
 		 151 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  37.04 
 
 		 160 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  35.19 
 
 		 151 aa  50.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  35.19 
 
 		 151 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  33.19 
 
 		 245 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2046  cryptic curlin major subunit  35.48 
 
 		 151 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00217142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  27.65 
 
 		 502 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2229  cryptic curlin major subunit  35.48 
 
 		 151 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  30.92 
 
 		 151 aa  48.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1210  cryptic curlin major subunit  35.48 
 
 		 151 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.519836  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1255  cryptic curlin major subunit  35.48 
 
 		 151 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.662472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1240  cryptic curlin major subunit  35.48 
 
 		 151 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  38.33 
 
 		 183 aa  47.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  31.61 
 
 		 178 aa  47.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  33.66 
 
 		 139 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  33.66 
 
 		 139 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  33.06 
 
 		 170 aa  47.4  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  29.54 
 
 		 451 aa  47  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  31.21 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  33.66 
 
 		 139 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  33.66 
 
 		 139 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  31.21 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  33.66 
 
 		 139 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  30.31 
 
 		 496 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  37.74 
 
 		 157 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  29.51 
 
 		 482 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  27.86 
 
 		 496 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  34.48 
 
 		 156 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>