18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0034 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0034  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  778    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  33.46 
 
 		 552 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  31.27 
 
 		 627 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  32.39 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  33.05 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  28.77 
 
 		 453 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  29.05 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2416  hypothetical protein  28.36 
 
 		 235 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  28.18 
 
 		 564 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  24.52 
 
 		 502 aa  53.1  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  28.94 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  29.21 
 
 		 483 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  24.43 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  24.88 
 
 		 496 aa  47  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1558  cryptic curlin major subunit  41.9 
 
 		 149 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  25 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  28.69 
 
 		 451 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  27.23 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>