59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2947 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  946    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  58.35 
 
 		 496 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  57.26 
 
 		 502 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  57.06 
 
 		 502 aa  511  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  57.77 
 
 		 502 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  57.34 
 
 		 496 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  57.75 
 
 		 496 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  57.55 
 
 		 496 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  57.55 
 
 		 496 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  53.68 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  55 
 
 		 498 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  40.04 
 
 		 451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  33.95 
 
 		 483 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  28.97 
 
 		 552 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  28.96 
 
 		 453 aa  97.1  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  29.21 
 
 		 627 aa  91.3  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  29.45 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  27.49 
 
 		 483 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  27.01 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  27.48 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  28.44 
 
 		 517 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  27.41 
 
 		 498 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  28.4 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  25.78 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  27.27 
 
 		 564 aa  60.1  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  27.3 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  34.87 
 
 		 170 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  26.68 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  38.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  38.89 
 
 		 139 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  38.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  38.89 
 
 		 139 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  37.78 
 
 		 139 aa  54.3  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  29.61 
 
 		 314 aa  53.9  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  29.61 
 
 		 578 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  35.34 
 
 		 144 aa  53.9  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  31.82 
 
 		 144 aa  53.5  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  25.58 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  28.64 
 
 		 190 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  30.77 
 
 		 142 aa  50.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  31.37 
 
 		 157 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  31.37 
 
 		 157 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  28.87 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  34.51 
 
 		 183 aa  49.3  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  32.35 
 
 		 151 aa  48.5  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  31.37 
 
 		 157 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  29.67 
 
 		 151 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  29.67 
 
 		 151 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  29.67 
 
 		 151 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  29.67 
 
 		 151 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  29.67 
 
 		 151 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  31.37 
 
 		 156 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  36.9 
 
 		 139 aa  47.4  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  33 
 
 		 139 aa  47  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0032  hypothetical protein  32.17 
 
 		 214 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0801235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  41.33 
 
 		 143 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  26.78 
 
 		 183 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  35.71 
 
 		 139 aa  44.3  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  31.87 
 
 		 139 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>