72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0842 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  100 
 
 
139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  100 
 
 
139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  97.12 
 
 
139 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  96.4 
 
 
139 aa  263  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  93.53 
 
 
139 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  76.98 
 
 
139 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  76.26 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  76.26 
 
 
139 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  56.34 
 
 
142 aa  147  6e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  54.68 
 
 
139 aa  140  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  54.86 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  60 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  40.91 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  40.71 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  40.95 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  40.95 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  41.32 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  44.58 
 
 
517 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  38.89 
 
 
500 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  31.54 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  26.8 
 
 
170 aa  52.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  42.11 
 
 
552 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  39.47 
 
 
496 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  39.47 
 
 
496 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  39.47 
 
 
496 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  35.37 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  39.47 
 
 
496 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  39.05 
 
 
183 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  38.1 
 
 
392 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  39.29 
 
 
496 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  36.05 
 
 
502 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  36.05 
 
 
502 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  40 
 
 
502 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  32.99 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  35.71 
 
 
503 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  37.93 
 
 
177 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  32.99 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  32.99 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  32.99 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  32.99 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  36.27 
 
 
498 aa  47.4  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  42.86 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  33.66 
 
 
564 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  28.57 
 
 
453 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  40 
 
 
160 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  33.33 
 
 
183 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01502  minor curlin subunit CsgB, putative  33.05 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  34.94 
 
 
245 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  32.99 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  32.99 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  37.74 
 
 
578 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01046  hypothetical protein  32.67 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  32.99 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  32.99 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01039  cryptic curlin major subunit  32.67 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2603  cryptic curlin major subunit  32.67 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.761097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  32.99 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2730  putative minor curlin subunit precursor (fimbrin sef17 minor subunit)  33.33 
 
 
169 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  32.99 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1161  cryptic curlin major subunit  32.67 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.401607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  32.99 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1162  cryptic curlin major subunit  32.67 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.596928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2557  cryptic curlin major subunit  32.67 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  36.63 
 
 
451 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  28.81 
 
 
434 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  30.5 
 
 
483 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  32 
 
 
627 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  34.41 
 
 
483 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3750  Curlin associated repeat protein  34.34 
 
 
585 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  25.36 
 
 
281 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2589  hypothetical protein  36.26 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226029  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0032  hypothetical protein  39.45 
 
 
214 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0801235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>