26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2727 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  100 
 
 		 482 aa  914    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  45.08 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  41.86 
 
 		 434 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  27.48 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  27.68 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  30.31 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  31.3 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  27.59 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  30.94 
 
 		 177 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  28.31 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  30.21 
 
 		 498 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  29.01 
 
 		 496 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  28.82 
 
 		 481 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  29.01 
 
 		 496 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  29.01 
 
 		 496 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  28.9 
 
 		 502 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  29.01 
 
 		 496 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  28.79 
 
 		 496 aa  51.2  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  28.9 
 
 		 627 aa  51.2  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  29.23 
 
 		 498 aa  50.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  29.86 
 
 		 578 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3330  curlin associated  31.62 
 
 		 151 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  28.54 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  30.25 
 
 		 457 aa  47.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  29.42 
 
 		 415 aa  47  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  29.01 
 
 		 502 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>