39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01503 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  100 
 
 		 483 aa  930    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  36.97 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  36.97 
 
 		 496 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  36.97 
 
 		 496 aa  193  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  35.63 
 
 		 496 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  36.72 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  34.63 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  35.57 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  36.84 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  31.86 
 
 		 496 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  32.83 
 
 		 500 aa  160  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  32.58 
 
 		 498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  31.88 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  29.19 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  26.81 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  29.15 
 
 		 627 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  29.2 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  30.51 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  28.87 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  25.74 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  30.5 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  27.35 
 
 		 434 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  26.99 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  25.88 
 
 		 498 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1274  hypothetical protein  31.03 
 
 		 163 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2589  hypothetical protein  34.13 
 
 		 180 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  32.37 
 
 		 139 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  32.71 
 
 		 139 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  38.82 
 
 		 143 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  31.78 
 
 		 139 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  34.94 
 
 		 144 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0032  hypothetical protein  34.78 
 
 		 214 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0801235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  29.2 
 
 		 139 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  30.5 
 
 		 139 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  28.48 
 
 		 517 aa  43.9  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  30.5 
 
 		 139 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0034  hypothetical protein  27.62 
 
 		 400 aa  43.9  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  26.98 
 
 		 392 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  29.93 
 
 		 139 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>