50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1514 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  100 
 
 		 517 aa  999    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  48.14 
 
 		 552 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  36.99 
 
 		 627 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  30.74 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  31.92 
 
 		 481 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  29.7 
 
 		 564 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  29.47 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  28.16 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  27.94 
 
 		 502 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  27.68 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  30.85 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  29.34 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  29.98 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  32.29 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  31.97 
 
 		 496 aa  72  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  28.29 
 
 		 496 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  33.11 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  31.29 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  30.95 
 
 		 496 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  30.95 
 
 		 496 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  30.91 
 
 		 578 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  28.22 
 
 		 503 aa  66.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  32.48 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  46.99 
 
 		 139 aa  62.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  45.78 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  45.78 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  32.91 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  44.58 
 
 		 139 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  44.58 
 
 		 139 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0034  hypothetical protein  33.05 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  31.03 
 
 		 498 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  31.71 
 
 		 156 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  35.51 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  29.6 
 
 		 281 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  29.27 
 
 		 157 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  30.08 
 
 		 157 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  32.3 
 
 		 151 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  32.3 
 
 		 151 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  31.33 
 
 		 151 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  32.3 
 
 		 151 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  32.3 
 
 		 151 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  28.46 
 
 		 157 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  26.75 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  34.55 
 
 		 144 aa  48.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  28 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  38.55 
 
 		 139 aa  47  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  31.67 
 
 		 154 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  38.55 
 
 		 139 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  38.55 
 
 		 139 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  34.75 
 
 		 170 aa  43.5  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>