54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6066 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  100 
 
 
578 aa  1080    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  35.7 
 
 
470 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1877  Curlin associated repeat protein  30.09 
 
 
441 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  31.31 
 
 
392 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  30.69 
 
 
552 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  31.81 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  29.32 
 
 
453 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  30.91 
 
 
517 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  27.77 
 
 
627 aa  64.3  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  27.65 
 
 
564 aa  63.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  30.51 
 
 
483 aa  60.1  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  30.05 
 
 
500 aa  59.7  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  32.79 
 
 
241 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  26.49 
 
 
483 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  41 
 
 
143 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  32.06 
 
 
457 aa  53.9  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  37.5 
 
 
142 aa  53.9  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  38.1 
 
 
160 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.230335 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  37.14 
 
 
151 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  36.17 
 
 
160 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  37.14 
 
 
151 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  37.14 
 
 
151 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  34.85 
 
 
156 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  36.17 
 
 
160 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  37.14 
 
 
151 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  37.14 
 
 
151 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  36.75 
 
 
183 aa  51.2  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  33.33 
 
 
157 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  31.48 
 
 
482 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  34.35 
 
 
434 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  38.32 
 
 
157 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  35.87 
 
 
151 aa  48.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  34.23 
 
 
178 aa  47.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  33.86 
 
 
144 aa  47.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  35.34 
 
 
183 aa  48.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  27.64 
 
 
481 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  38.68 
 
 
139 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  28.57 
 
 
481 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  36.17 
 
 
151 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  36.17 
 
 
151 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  36.17 
 
 
151 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  38.68 
 
 
139 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  38.68 
 
 
139 aa  47.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  27.79 
 
 
498 aa  47  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  36.17 
 
 
151 aa  47  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  37.14 
 
 
151 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  35.25 
 
 
154 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  35.85 
 
 
157 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  34.91 
 
 
139 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  37.74 
 
 
139 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  37.74 
 
 
139 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  35.85 
 
 
139 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  28.08 
 
 
502 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  31.82 
 
 
177 aa  43.5  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>