59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3136 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  88.1 
 
 		 496 aa  826    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  76.1 
 
 		 502 aa  737    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  87.7 
 
 		 496 aa  824    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  87.9 
 
 		 496 aa  825    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  100 
 
 		 496 aa  952    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  88.51 
 
 		 496 aa  840    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  78.09 
 
 		 502 aa  758    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  78.09 
 
 		 502 aa  759    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  54.38 
 
 		 503 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  57.34 
 
 		 500 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  55.82 
 
 		 498 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  40.22 
 
 		 451 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  31.86 
 
 		 483 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  29.95 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  27.94 
 
 		 498 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  30.43 
 
 		 552 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  30.95 
 
 		 517 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  28.32 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  27.78 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  28.5 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  27.34 
 
 		 627 aa  60.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  26.82 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  35.94 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  32.41 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  26.76 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  32.84 
 
 		 144 aa  56.6  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  27.62 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  28.79 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  30.22 
 
 		 314 aa  52  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  25.25 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  41.43 
 
 		 139 aa  50.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  39.29 
 
 		 139 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  39.29 
 
 		 139 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  45.71 
 
 		 144 aa  50.1  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  36.17 
 
 		 139 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  36.17 
 
 		 139 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  38.57 
 
 		 139 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  31.25 
 
 		 190 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  36.84 
 
 		 139 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  38.57 
 
 		 139 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  27.67 
 
 		 241 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  31.43 
 
 		 151 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  33.04 
 
 		 156 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  31.43 
 
 		 160 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  31.43 
 
 		 151 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  31.43 
 
 		 151 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  31.43 
 
 		 151 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  31.43 
 
 		 151 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3750  Curlin associated repeat protein  29.68 
 
 		 585 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  30.47 
 
 		 142 aa  44.3  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  30.48 
 
 		 151 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  30.48 
 
 		 151 aa  43.9  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  30.48 
 
 		 151 aa  43.9  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  30.48 
 
 		 151 aa  43.9  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  30.48 
 
 		 151 aa  43.9  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  30.48 
 
 		 160 aa  43.5  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  30.48 
 
 		 160 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  26.22 
 
 		 564 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  37.97 
 
 		 143 aa  43.5  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>