71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3398 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  100 
 
 		 157 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  92.36 
 
 		 157 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  96.82 
 
 		 157 aa  273  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  87.9 
 
 		 156 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  59.57 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  38.04 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  46.32 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  41.9 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  40.95 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  43.82 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  36.36 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  34.52 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  41.9 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  36.36 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  43.82 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  41.9 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  36.36 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  40.95 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  41.9 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  32.26 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  40.95 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  40.95 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  38.94 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  36.19 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  38.05 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  38.05 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  38.05 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  38.05 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  38.05 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  38.05 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  38.05 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  37.17 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  36.75 
 
 		 552 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  33.33 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  32.28 
 
 		 627 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  30.38 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  31.37 
 
 		 500 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  29.79 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  30.77 
 
 		 503 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  38.75 
 
 		 453 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  32.38 
 
 		 170 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  33.04 
 
 		 502 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2589  hypothetical protein  36.43 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  35.85 
 
 		 578 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1558  cryptic curlin major subunit  37.14 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  40.58 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0032  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0801235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  29.3 
 
 		 502 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  29.14 
 
 		 496 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  30.77 
 
 		 564 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  29.68 
 
 		 502 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  28.46 
 
 		 517 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  29.68 
 
 		 496 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  29.22 
 
 		 481 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  29.14 
 
 		 415 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0006  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  31.86 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0926  hypothetical protein  36.62 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0402571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1422  cryptic curlin major subunit  34.29 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  30.61 
 
 		 245 aa  41.2  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01502  minor curlin subunit CsgB, putative  34.09 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2557  cryptic curlin major subunit  34.29 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  34.52 
 
 		 481 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1162  cryptic curlin major subunit  34.29 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.596928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1161  cryptic curlin major subunit  34.29 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.401607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01046  hypothetical protein  34.29 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  32.1 
 
 		 498 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2603  cryptic curlin major subunit  34.29 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.761097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01039  cryptic curlin major subunit  34.29 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2089  cryptic curlin major subunit  34.29 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  32.17 
 
 		 483 aa  40.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>