38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2364 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  72.14 
 
 		 481 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  93.35 
 
 		 481 aa  868    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  100 
 
 		 498 aa  979    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  57.35 
 
 		 483 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  28.02 
 
 		 552 aa  91.3  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  31.12 
 
 		 627 aa  90.5  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  27.59 
 
 		 564 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  28.81 
 
 		 496 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  30.28 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  28.51 
 
 		 502 aa  77  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  29.66 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  27.38 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  29.84 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  27.94 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  28.99 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  27.37 
 
 		 496 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  27.37 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  26.33 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  26.33 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  27.41 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  27.3 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  27.72 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  35.38 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  25 
 
 		 498 aa  57  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  31.79 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  29.82 
 
 		 457 aa  53.9  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  30.48 
 
 		 281 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  29.48 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  35.71 
 
 		 183 aa  50.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  30.56 
 
 		 177 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  25.88 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  30.23 
 
 		 170 aa  47.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  32.79 
 
 		 144 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  30.72 
 
 		 245 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  33.07 
 
 		 183 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  28.62 
 
 		 241 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  27.49 
 
 		 314 aa  43.5  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  34.21 
 
 		 157 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>