68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1515 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  100 
 
 		 178 aa  351  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  55.43 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  44.91 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  40.13 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  34.21 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  39.06 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  43.48 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  42.15 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  43.48 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  41.32 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  41.32 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  37.5 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  34.92 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  33.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  33.81 
 
 		 552 aa  60.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  32.26 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  35.38 
 
 		 481 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  33.33 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  35.38 
 
 		 498 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  40 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  46.84 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  35.64 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  35.64 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  35.64 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  35.64 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  35.64 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  35.64 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  35.64 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  36.63 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  36.63 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  36.63 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  36.63 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  36.63 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  35.64 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  34.15 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  35.54 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  33.61 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  34.65 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  34.88 
 
 		 481 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  34.21 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  34.23 
 
 		 578 aa  47.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  33.77 
 
 		 627 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  32.17 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  31.61 
 
 		 564 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2229  cryptic curlin major subunit  31.82 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2046  cryptic curlin major subunit  31.82 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00217142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1210  cryptic curlin major subunit  31.82 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.519836  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2089  cryptic curlin major subunit  33.64 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1240  cryptic curlin major subunit  31.82 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1255  cryptic curlin major subunit  31.82 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.662472 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1161  cryptic curlin major subunit  33.64 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.401607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01046  hypothetical protein  33.64 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1422  cryptic curlin major subunit  33.64 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2557  cryptic curlin major subunit  33.64 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1162  cryptic curlin major subunit  33.64 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.596928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  31.25 
 
 		 483 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2603  cryptic curlin major subunit  33.64 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.761097  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01039  cryptic curlin major subunit  33.64 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2730  putative minor curlin subunit precursor (fimbrin sef17 minor subunit)  36.79 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2589  hypothetical protein  35.04 
 
 		 180 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226029  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  33.94 
 
 		 502 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0032  hypothetical protein  31.1 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0801235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  29.19 
 
 		 500 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  40.7 
 
 		 434 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1558  cryptic curlin major subunit  30.84 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  31.54 
 
 		 453 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  31.01 
 
 		 482 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  32.73 
 
 		 392 aa  40.8  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>