52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3299 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  100 
 
 		 139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  54.68 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  54.68 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  55.4 
 
 		 139 aa  140  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  55.4 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  55.4 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  55.4 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  65.77 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  64.86 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  59.09 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  54.05 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  52.63 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  38.1 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  36.19 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  36.19 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  36.19 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  32.08 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  37.08 
 
 		 502 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  34.86 
 
 		 496 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  32.17 
 
 		 178 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  38.04 
 
 		 552 aa  47.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  37.5 
 
 		 392 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  32.11 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  36.75 
 
 		 496 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  32.11 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  32.11 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  35.96 
 
 		 496 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  32.11 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  36.75 
 
 		 496 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  35.51 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  39.53 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  32.11 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  31.15 
 
 		 503 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  31.87 
 
 		 500 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  31.91 
 
 		 498 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  31.19 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  31.19 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  36.8 
 
 		 502 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  31.19 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  34.75 
 
 		 451 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  31.19 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  31.19 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  31.19 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  31.19 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  34.83 
 
 		 496 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01502  minor curlin subunit CsgB, putative  39.47 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  31.19 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  28.12 
 
 		 502 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  36.26 
 
 		 517 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  34.94 
 
 		 453 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  34.18 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  32.53 
 
 		 483 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>