28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2046 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2229  cryptic curlin major subunit  100 
 
 
151 aa  297  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2046  cryptic curlin major subunit  100 
 
 
151 aa  297  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00217142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1210  cryptic curlin major subunit  100 
 
 
151 aa  297  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.519836  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1255  cryptic curlin major subunit  100 
 
 
151 aa  297  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.662472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1240  cryptic curlin major subunit  100 
 
 
151 aa  297  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2603  cryptic curlin major subunit  74.83 
 
 
151 aa  186  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.761097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01046  hypothetical protein  74.83 
 
 
151 aa  186  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2557  cryptic curlin major subunit  74.83 
 
 
151 aa  186  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1162  cryptic curlin major subunit  74.83 
 
 
151 aa  186  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.596928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1161  cryptic curlin major subunit  74.83 
 
 
151 aa  186  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.401607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01039  cryptic curlin major subunit  74.83 
 
 
151 aa  186  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2089  cryptic curlin major subunit  74.17 
 
 
151 aa  183  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.226612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1422  cryptic curlin major subunit  73.03 
 
 
152 aa  178  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1558  cryptic curlin major subunit  66.23 
 
 
149 aa  174  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  34.62 
 
 
564 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  32.76 
 
 
178 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  31.73 
 
 
481 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  34.88 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  33.04 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  28.36 
 
 
552 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  37.38 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  35.59 
 
 
415 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  28.77 
 
 
498 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  32.08 
 
 
142 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  35.58 
 
 
245 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  31.78 
 
 
496 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  31.82 
 
 
496 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  31.82 
 
 
496 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>