19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0032 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0032  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  410  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0801235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  35.68 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  34.31 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  34.06 
 
 		 157 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  31.63 
 
 		 502 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  33.77 
 
 		 483 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  33.33 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  33.99 
 
 		 434 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  29.55 
 
 		 502 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  32.17 
 
 		 500 aa  45.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  27.48 
 
 		 502 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  33.33 
 
 		 157 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  30.43 
 
 		 503 aa  45.1  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  34.78 
 
 		 483 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  35.9 
 
 		 552 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  40.37 
 
 		 139 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  31.1 
 
 		 178 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  31.94 
 
 		 498 aa  41.6  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  38.6 
 
 		 139 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>