41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3300 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  100 
 
 		 451 aa  830    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  42.25 
 
 		 496 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  41.57 
 
 		 502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  41.38 
 
 		 502 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  42.86 
 
 		 502 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  41.67 
 
 		 496 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  42.05 
 
 		 496 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  41.67 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  41.67 
 
 		 496 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  38.34 
 
 		 498 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  39.01 
 
 		 500 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  37.96 
 
 		 503 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  31.89 
 
 		 483 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  31.26 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  30.28 
 
 		 498 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  29.98 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  31.69 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  32.55 
 
 		 552 aa  84  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  29.84 
 
 		 627 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  27.8 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  28.15 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  25.53 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  29.83 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  36.79 
 
 		 142 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  27.62 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  36.84 
 
 		 144 aa  57  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  30.57 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  35.11 
 
 		 170 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  28.76 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  32.88 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  36.63 
 
 		 139 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  36.63 
 
 		 139 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1274  hypothetical protein  36.11 
 
 		 163 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  28.47 
 
 		 281 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  30.08 
 
 		 241 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  28.68 
 
 		 144 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  35.64 
 
 		 139 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  32.91 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  34.65 
 
 		 139 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  30.12 
 
 		 314 aa  43.9  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  34.75 
 
 		 139 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>