49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0864 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  88.1 
 
 		 496 aa  839    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  79.48 
 
 		 502 aa  758    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  95.56 
 
 		 496 aa  900    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  99.4 
 
 		 496 aa  937    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  100 
 
 		 496 aa  940    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  80.68 
 
 		 502 aa  779    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  80.88 
 
 		 502 aa  780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  99.6 
 
 		 496 aa  938    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  54.18 
 
 		 503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  57.75 
 
 		 500 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  56.22 
 
 		 498 aa  491  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  40.22 
 
 		 451 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  36.88 
 
 		 483 aa  194  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  29.7 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  27 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  30.27 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  31.43 
 
 		 552 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  28.54 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1272  Curlin associated repeat protein  29.91 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  27.16 
 
 		 498 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  27.16 
 
 		 627 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  25.23 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  28.78 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  31.16 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  26.27 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  34.81 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  45.71 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  35.07 
 
 		 144 aa  57  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  32.95 
 
 		 170 aa  53.9  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  42.86 
 
 		 139 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  42.86 
 
 		 139 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  42.86 
 
 		 139 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  39.47 
 
 		 139 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  39.47 
 
 		 139 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  41.67 
 
 		 139 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  47.14 
 
 		 144 aa  51.2  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  39.47 
 
 		 139 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2864  curlin associated precursor, CsgA like  29.59 
 
 		 314 aa  51.2  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.792578  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2727  curlin associated  27.8 
 
 		 482 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.849667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2415  curlin-associated protein  27.83 
 
 		 190 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  27.48 
 
 		 564 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  30.94 
 
 		 241 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  27.87 
 
 		 457 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  36.75 
 
 		 139 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  29.41 
 
 		 142 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  37.5 
 
 		 143 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1274  hypothetical protein  36.79 
 
 		 163 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  30.38 
 
 		 183 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1513  curlin-associated protein  34.78 
 
 		 177 aa  43.9  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>