27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0487 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  68.24 
 
 		 240 aa  329  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  70.09 
 
 		 234 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  74.06 
 
 		 233 aa  299  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  74.06 
 
 		 233 aa  299  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  56.41 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  49.79 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  50.43 
 
 		 234 aa  205  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  49.79 
 
 		 227 aa  204  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  50 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  33.89 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  37.96 
 
 		 242 aa  98.2  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  37.98 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  34.13 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  35.24 
 
 		 236 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  33.65 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  35.71 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  33.06 
 
 		 243 aa  88.2  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  35.98 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  35.41 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  30.17 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  30.72 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  30.32 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04060  elongation factor Ts  30.67 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2819  hypothetical protein  30.71 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4305  hypothetical protein  25.55 
 
 		 310 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>