24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49342 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  100 
 
 
295 aa  611  9.999999999999999e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38008  predicted protein  61.18 
 
 
217 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  31.53 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  34.95 
 
 
236 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  38.03 
 
 
242 aa  85.5  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  34.47 
 
 
236 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  33.64 
 
 
240 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  30.69 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  34.17 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  33.02 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  32.41 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  33.17 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  30.84 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  28.96 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  29.49 
 
 
227 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  27.52 
 
 
233 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  29.38 
 
 
239 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  27.68 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  28.17 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  28.17 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  27.19 
 
 
234 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  26.45 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  28.44 
 
 
233 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  30.77 
 
 
513 aa  49.3  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>