26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0582 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  518  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  39.71 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  34.91 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  36.36 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  34.3 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  41.79 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  33.89 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  31.53 
 
 		 295 aa  98.6  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  32.38 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  33.33 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  34.34 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  32.17 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  36.09 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  32.51 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  33.73 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  35.5 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  29.05 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  30.92 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38008  predicted protein  33.58 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  29.29 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04060  elongation factor Ts  29.03 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  26.11 
 
 		 513 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  26.06 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>