26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001204 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  95.24 
 
 		 231 aa  448  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  46.38 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  49.51 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  45.02 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  45 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  42.98 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  43.78 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  41.18 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  35.44 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  34.32 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  30.7 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  34.34 
 
 		 249 aa  90.9  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  29.82 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  32.86 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  32.86 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  34.62 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  31.8 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  33.8 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  32.56 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  32.57 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  34.38 
 
 		 276 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2819  hypothetical protein  28.82 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  28.33 
 
 		 513 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38008  predicted protein  33.1 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>