24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0290 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  61.76 
 
 		 242 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  63.3 
 
 		 236 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  62.84 
 
 		 236 aa  271  6e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  56.28 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  45.56 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  45.83 
 
 		 231 aa  178  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  39 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  43.39 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  44.98 
 
 		 239 aa  168  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  36.82 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  36.32 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  32.41 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  35.02 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  33.02 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  35.5 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  35.98 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  32.72 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  32.56 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  30.92 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  30.92 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  32.86 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  32.7 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38008  predicted protein  30 
 
 		 217 aa  42  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>