26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0486 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  64.82 
 
 		 236 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  64.82 
 
 		 236 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  59.23 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  56.28 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  45.27 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  45.45 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  43.51 
 
 		 231 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  41.84 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  42.5 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  38.97 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  34.4 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  36.76 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  35.48 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  35.02 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  33.18 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  33.18 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  35.24 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  33.73 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  32.7 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  34.27 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  32.87 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  29.68 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2819  hypothetical protein  29.11 
 
 		 263 aa  48.5  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  27.83 
 
 		 513 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38008  predicted protein  26.43 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>