25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3702 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  44.2 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  41.67 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  41.92 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  43.89 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  43.89 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  37.76 
 
 		 243 aa  164  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  40.97 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  42.44 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  41.18 
 
 		 231 aa  141  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  32.41 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  30.37 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  30.8 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  30.9 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  31.46 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  31.46 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  29.05 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  29.33 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  32.05 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  28.72 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  29.86 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  26.45 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2819  hypothetical protein  29.34 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  31.9 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  28.26 
 
 		 513 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>