26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0220 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  63.2 
 
 		 239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  57.38 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  52.8 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  52.8 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  52.34 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  47.08 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  47.48 
 
 		 227 aa  204  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  46.64 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  49.07 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  37.74 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  37.26 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  35.85 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  31.95 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  35.21 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  35.85 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  35.68 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  33.64 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  32.86 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  32.43 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  35 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  31.28 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  26.94 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  28.85 
 
 		 513 aa  52.8  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04060  elongation factor Ts  29.56 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2819  hypothetical protein  33.09 
 
 		 263 aa  42.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>