25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0653 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  63.2 
 
 		 234 aa  258  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  53.62 
 
 		 227 aa  241  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  52.97 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  51.03 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  50.22 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  54.67 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  54.67 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  53.71 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  50.21 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  34.69 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  35.65 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  33.8 
 
 		 242 aa  91.7  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  31.92 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  33.8 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  31.92 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  32.56 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  32.56 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  30.13 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  28.72 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  27.35 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  31.25 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  32.68 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2819  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>