25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001203 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  95.15 
 
 
227 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  52.77 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  48.95 
 
 
240 aa  221  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  53.05 
 
 
233 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  53.05 
 
 
233 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  49.14 
 
 
233 aa  205  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  50 
 
 
234 aa  202  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  49.79 
 
 
233 aa  198  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  46.64 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  34.91 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  36.76 
 
 
241 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  35.44 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  33.91 
 
 
231 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  35.47 
 
 
236 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  35.47 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  36.82 
 
 
242 aa  95.1  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  36.82 
 
 
243 aa  91.7  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  34.65 
 
 
243 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  30.37 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  30.69 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  29.44 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  27.15 
 
 
513 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  32.93 
 
 
276 aa  62  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38008  predicted protein  28.82 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>