25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3279 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  473  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  99.58 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  65.55 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  60.52 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  59.75 
 
 		 243 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  46.81 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  48.54 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  46.47 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  48.56 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  44.69 
 
 		 244 aa  183  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  33.8 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  35.47 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  34.48 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  33.65 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  33.65 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  33.64 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  33.67 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  32.57 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  36.79 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  34.47 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  32.7 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  31.82 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  31.61 
 
 		 513 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  32.92 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38008  predicted protein  31.43 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>