27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04990 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  95.15 
 
 
227 aa  437  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  52.12 
 
 
239 aa  228  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  50.21 
 
 
240 aa  224  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  54.46 
 
 
233 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  54.46 
 
 
233 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  50.89 
 
 
233 aa  205  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  49.53 
 
 
234 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  50 
 
 
233 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  45.8 
 
 
234 aa  192  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  39.71 
 
 
249 aa  122  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  34.4 
 
 
241 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  33.91 
 
 
231 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  34.32 
 
 
231 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  34.63 
 
 
236 aa  98.2  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  34.63 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  37.31 
 
 
242 aa  95.1  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  36.32 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  34.16 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  30.9 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  30.88 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  30 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  25.34 
 
 
513 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  32.05 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38008  predicted protein  28.82 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04060  elongation factor Ts  26.83 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2819  hypothetical protein  28.08 
 
 
263 aa  42.7  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>