25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3418 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  67.28 
 
 		 236 aa  287  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  66.82 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  60.52 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  58.55 
 
 		 241 aa  247  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  48.05 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  46.38 
 
 		 231 aa  185  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  45.02 
 
 		 231 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  42.34 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  41.92 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  34.41 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  36.24 
 
 		 234 aa  99  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  37.31 
 
 		 227 aa  95.1  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  36.82 
 
 		 227 aa  95.1  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  35.89 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  35.89 
 
 		 233 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  36.24 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  34.27 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  32.51 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  38.03 
 
 		 295 aa  85.5  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  34.91 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  33.02 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  31.9 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38008  predicted protein  31.43 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  32.05 
 
 		 513 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>