26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04991 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  95.24 
 
 
231 aa  448  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  52.24 
 
 
236 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  45.11 
 
 
243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  51.74 
 
 
236 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  46.38 
 
 
242 aa  185  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  45.42 
 
 
243 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  46.77 
 
 
241 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  44.06 
 
 
239 aa  160  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  42.44 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  33.91 
 
 
227 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  33.91 
 
 
227 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  31.63 
 
 
240 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  30.7 
 
 
234 aa  94.4  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  31.9 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  31.9 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  32.17 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  34.62 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  34.43 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  31.67 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  33.8 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  33.49 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  36.02 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2819  hypothetical protein  28.82 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260084  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  27.96 
 
 
513 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38008  predicted protein  32.39 
 
 
217 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>