23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0219 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  483  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  47.03 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  45.22 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  43.98 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  48.47 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  48.47 
 
 		 236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  42.74 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  43.88 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  44.06 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  39.67 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  32.42 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  33.97 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  30.88 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  30.69 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  33.49 
 
 		 234 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  29.38 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  29.38 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  30.5 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  29.38 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  31.43 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  29.58 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  32.89 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  30.4 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>