26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0652 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0652  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3418  hypothetical protein  48.05 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0219  hypothetical protein  47.85 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0290  hypothetical protein  44.76 
 
 		 243 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0668  hypothetical protein  47.22 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3279  hypothetical protein  46.76 
 
 		 236 aa  195  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0613272 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001204  hypothetical protein  46.38 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04991  hypothetical protein  45.11 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0486  hypothetical protein  44.44 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.434218  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3702  hypothetical protein  40.97 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.257264  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  37.5 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001203  hypothetical protein  34.65 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  34.16 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  34.1 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  33.06 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49342  predicted protein  30.69 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  29.49 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  29.49 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  32.26 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0653  hypothetical protein  29.57 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  30.92 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38008  predicted protein  31.43 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  30.7 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3778  hypothetical protein  30.57 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2819  hypothetical protein  26.44 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.260084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0158  hypothetical protein  35.05 
 
 		 513 aa  45.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>