11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04060 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04060  elongation factor Ts  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3417  hypothetical protein  28.95 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0291  hypothetical protein  31.33 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.782993 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3280  hypothetical protein  30.26 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10981 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0667  hypothetical protein  30.26 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.202075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0582  hypothetical protein  29.03 
 
 		 249 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.259342  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48425  spondin like protein  29.93 
 
 		 332 aa  48.9  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0487  hypothetical protein  30.46 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.791512  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3701  hypothetical protein  30.2 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162275 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04990  hypothetical protein  26.83 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0220  hypothetical protein  31.85 
 
 		 234 aa  42  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>