More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1347 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1378  ABC nickel/di-oligopepetide transporter, permease subunit  99.63 
 
 
270 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.405632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1923  ABC nickel/di-oligopepetide transporter, permease subunit  99.63 
 
 
270 aa  534  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00290921  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1347  nickel/di-oligopepetide ABC transporter permease subunit  100 
 
 
270 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371314  normal  0.322841 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2104  Adipeptide/di-oligopeptide/nickel ABC transporter permease subunit  98.89 
 
 
270 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000641453 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1363  ABC nickel/di-oligopepetide transporter, permease subunit  99.26 
 
 
270 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0141464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1073  nickel ABC transporter, permease protein  61.28 
 
 
268 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.28 
 
 
268 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0682629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3549  binding-protein-dependent transport protein  60.53 
 
 
263 aa  294  9e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00345403  normal  0.0594422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1327  dipeptide ABC transporter, permease protein  46.75 
 
 
276 aa  195  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0189  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.15 
 
 
273 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
273 aa  193  3e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.2 
 
 
353 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.26861  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
283 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.87 
 
 
292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.943696  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
286 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
289 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00200044  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1343  dipeptide ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
285 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0214  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.06 
 
 
291 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
287 aa  175  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
271 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.98 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 
276 aa  155  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1677  oligopeptide transport system permease protein OppC  43.19 
 
 
276 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03990  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.83 
 
 
277 aa  143  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.518636  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0308  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.89 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1093  peptide ABC transporter, permease protein, putative  36.24 
 
 
296 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0433  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
262 aa  120  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
310 aa  118  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
359 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.431042  normal  0.667573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
286 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
290 aa  115  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2990  peptide ABC transporter, permease protein  31.05 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.905505  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
279 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
299 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
285 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.886344  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7616  nickel transporter permease NikC  33.76 
 
 
291 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
273 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.609485 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0802  nickel transporter permease NikC  33.05 
 
 
290 aa  112  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.766345 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0752  nickel transporter permease NikC  33.05 
 
 
290 aa  112  9e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
258 aa  112  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
310 aa  112  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0983595 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0951  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.292218  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  30.22 
 
 
867 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2420  dipeptide ABC transport system inner membrane binding component DppC  31.76 
 
 
288 aa  109  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000767733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
266 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
293 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2275  nickel transporter permease NikC  34.6 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0126063  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
306 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0211  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 
334 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
299 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 
303 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.64 
 
 
284 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
289 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.22 
 
 
306 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34310  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.71 
 
 
324 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0204  hypothetical protein  27.41 
 
 
286 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5113  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 
334 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0213  hypothetical protein  27.41 
 
 
286 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
275 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
291 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0926789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
334 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  31.17 
 
 
308 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0230  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.32 
 
 
334 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2115  peptide ABC transporter membrane protein  32.23 
 
 
286 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
293 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0206  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.89 
 
 
334 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
309 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0187  oligopeptide ABC transporter permease  30.23 
 
 
334 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0186  oligopeptide ABC transporter permease protein  30.23 
 
 
334 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
312 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.32 
 
 
300 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0206  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 
334 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
301 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
299 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
299 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101748  normal  0.208268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
299 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
299 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
286 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
287 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0280346  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
268 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.216437  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.17 
 
 
298 aa  105  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0718  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 
298 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.8 
 
 
296 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.232197  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
291 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>