More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3477 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 287 aa  540  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0280346  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1601  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  52.08 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2532  putative ABC transporter  46.95 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7202  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  48.67 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2385  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  53.97 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.08 
 
 		 262 aa  225  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.766345 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.08 
 
 		 289 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.0365301 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.74 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.74 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 		 287 aa  218  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.54 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.4 
 
 		 286 aa  215  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115712  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.68 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.36 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.66 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.538661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4176  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.79 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  39.92 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  39.92 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  39.92 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  39.92 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  39.92 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.1 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 		 285 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156076  normal  0.42272 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 		 280 aa  199  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.38 
 
 		 286 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 		 285 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.29 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.45 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.216437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24420  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.53 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  43.64 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.09 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.59 
 
 		 285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 		 299 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 		 313 aa  195  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  42.4 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.9 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.36 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 		 280 aa  192  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 		 359 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.04 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 		 287 aa  191  9e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7173  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  43.51 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.46 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517971  normal  0.0190729 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.45 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 		 297 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1099  peptide ABC transporter, permease protein, putative  38.19 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  40.56 
 
 		 867 aa  188  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.38 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.58 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 		 285 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.15 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34310  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  46.3 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  41.15 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.77 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.99 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.77 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.77 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.77 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  43.89 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5291  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  47.22 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 		 298 aa  185  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00686598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2172  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  36.4 
 
 		 298 aa  185  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 		 301 aa  185  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 		 300 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.0461956 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  40.31 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 		 318 aa  185  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 		 279 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  40.31 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 		 296 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01443  D-ala-D-ala transporter subunit  36.4 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  41.31 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.843996 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01455  hypothetical protein  36.4 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1674  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  36.4 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>