More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0037 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00200044  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.68 
 
 
273 aa  311  1e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0189  oligopeptide ABC transporter, permease protein  53.56 
 
 
273 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 
286 aa  296  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.37 
 
 
292 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.943696  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
271 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1343  dipeptide ABC transporter, permease protein  52.96 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.02 
 
 
283 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1327  dipeptide ABC transporter, permease protein  48.89 
 
 
276 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0214  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.72 
 
 
291 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.45 
 
 
353 aa  268  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.26861  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.47 
 
 
287 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1347  nickel/di-oligopepetide ABC transporter permease subunit  40.87 
 
 
270 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371314  normal  0.322841 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1378  ABC nickel/di-oligopepetide transporter, permease subunit  40.87 
 
 
270 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.405632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1923  ABC nickel/di-oligopepetide transporter, permease subunit  40.87 
 
 
270 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00290921  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1363  ABC nickel/di-oligopepetide transporter, permease subunit  40.89 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0141464 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2104  Adipeptide/di-oligopeptide/nickel ABC transporter permease subunit  40 
 
 
270 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000641453 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1677  oligopeptide transport system permease protein OppC  45.45 
 
 
276 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1073  nickel ABC transporter, permease protein  39.6 
 
 
268 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 
268 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0682629  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
270 aa  177  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
307 aa  171  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03990  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  36.41 
 
 
277 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.518636  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0308  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.46 
 
 
298 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3549  binding-protein-dependent transport protein  38.4 
 
 
263 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00345403  normal  0.0594422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
276 aa  166  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
321 aa  165  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
318 aa  162  4.0000000000000004e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  37.5 
 
 
282 aa  162  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1002  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 
283 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
280 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
275 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4384  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 
283 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.52955e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0860  oligopeptide ABC transporter permease  35.2 
 
 
283 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0824  oligopeptide ABC transporter, permease  32.84 
 
 
283 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0809  oligopeptide ABC transporter, permease  35.2 
 
 
283 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1282  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
300 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284613  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0947  oligopeptide ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
283 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0910  oligopeptide ABC transporter permease protein  35.2 
 
 
283 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
283 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.789025  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 
281 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0983595 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  37.07 
 
 
279 aa  158  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
280 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0998  oligopeptide ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 
283 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.8284200000000003e-62 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0643  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.84 
 
 
292 aa  156  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
308 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.717145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4119  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  31.97 
 
 
282 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.24 
 
 
285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.886344  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
312 aa  155  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
287 aa  155  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
301 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
310 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
495 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
485 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
313 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  35.68 
 
 
479 aa  152  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
497 aa  152  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  34.98 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
309 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
325 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00471699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36 
 
 
284 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
293 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
494 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
310 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0590  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.62 
 
 
302 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305304  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
309 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
321 aa  151  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
295 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003659  oligopeptide transport system permease protein OppC  37 
 
 
310 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  36.44 
 
 
282 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1274  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
305 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000176481  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
310 aa  150  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  35.47 
 
 
473 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
289 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
285 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
299 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
310 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2420  dipeptide ABC transport system inner membrane binding component DppC  33.47 
 
 
288 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000767733 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
337 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
287 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
287 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
279 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.78 
 
 
300 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1883  peptide ABC transporter transmembrane protein  32.07 
 
 
311 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.122955  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
301 aa  149  8e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0479  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
304 aa  148  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477815  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.289806  normal  0.295413 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
496 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429723  normal  0.768739 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249945  normal  0.298261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
294 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00097283 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  32.89 
 
 
302 aa  146  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>