More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0117 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
281 aa  531  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0983595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.99 
 
 
285 aa  361  6e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.886344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.45 
 
 
266 aa  353  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03990  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  56.77 
 
 
277 aa  256  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.518636  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0308  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  41.56 
 
 
298 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
289 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
289 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00200044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
286 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0214  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.42 
 
 
291 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0189  oligopeptide ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 
273 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
287 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0013  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.47 
 
 
292 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.943696  normal  0.0118376 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
353 aa  157  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.26861  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
271 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1327  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.28 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
275 aa  149  6e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
310 aa  139  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1343  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.24 
 
 
285 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
305 aa  138  7.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
276 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
303 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2532  putative ABC transporter  37.55 
 
 
299 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
300 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.284254  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
399 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.02594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00197888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
280 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
285 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02947  hypothetical protein  32.81 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0611  oligopeptide ABC transporter, permease protein  33.2 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1948  oligopeptide transport system permease protein C  32.55 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.194033 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
280 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2030  oligopeptide ABC transporter permease protein  30.59 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0128641  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.385135  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1093  peptide ABC transporter, permease protein, putative  35.81 
 
 
296 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7192  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  36.8 
 
 
308 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.906692  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002961  oligopeptide transport system permease protein OppC  32.67 
 
 
300 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3198  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
260 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.0000000283157  unclonable  0.000000000020531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  34.91 
 
 
301 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
867 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.41 
 
 
318 aa  127  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170759  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.0495653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
494 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19890  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  35.96 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00186711  hitchhiker  0.000357505 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  31.14 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  35.38 
 
 
300 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0843  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  28.74 
 
 
337 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217859  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1028  dipeptide ABC transporter, permease protein  34.96 
 
 
309 aa  126  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.29309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
300 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 
282 aa  126  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
310 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
300 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
321 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
331 aa  125  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2472  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
296 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0718  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  32.76 
 
 
298 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  32.3 
 
 
473 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1492  peptide ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
279 aa  125  9e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  31.14 
 
 
279 aa  125  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
279 aa  125  9e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
300 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
305 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.238767  normal  0.85069 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 
290 aa  124  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  32.88 
 
 
479 aa  124  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2275  nickel transporter permease NikC  36.95 
 
 
299 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0126063  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
283 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28217  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5233  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
283 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
301 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
307 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
303 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1601  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.85 
 
 
278 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0187  oligopeptide ABC transporter permease  29.93 
 
 
334 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2990  peptide ABC transporter, permease protein  34.88 
 
 
296 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.905505  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0230  oligopeptide ABC transporter, permease protein  30.5 
 
 
334 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
299 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  33.33 
 
 
288 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0186  oligopeptide ABC transporter permease protein  29.93 
 
 
334 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
344 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
301 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.33 
 
 
306 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0206  oligopeptide ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
334 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
301 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
485 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.9 
 
 
305 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
303 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
361 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
343 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.519425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
274 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
293 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.141846  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2696  ABC transporter membrane spanning protein (agrocinopine)  32.29 
 
 
288 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>