64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3250 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  100 
 
 		 216 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  99.07 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  96.76 
 
 		 216 aa  436  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  76.85 
 
 		 216 aa  353  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  76.85 
 
 		 216 aa  353  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2884  CRISPR-associated Cse3 family protein  76.85 
 
 		 216 aa  352  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.542217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  76.39 
 
 		 216 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  44.13 
 
 		 215 aa  185  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3093  crispr-associated protein, Cse3 family  42.31 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3149  crispr-associated protein Cse3 family  42.31 
 
 		 234 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  41.89 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3543  CRISPR-associated Cse3 family protein  43.3 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410729  normal  0.0763733 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3586  CRISPR-associated protein, Cse3 family  41.67 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  39.91 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1603  CRISPR-associated protein, Cse3 family  37.55 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61218  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  34 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  33.63 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  33.63 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  34.22 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5410  CRISPR-associated protein, Cse3 family  38.16 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341034  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0423  CRISPR-associated protein, Cse3 family  38.39 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0256253  normal  0.0209563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0961  hypothetical protein  27.95 
 
 		 299 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  31.41 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2475  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.03 
 
 		 292 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2988  CRISPR-associated Cse3 family protein  47.47 
 
 		 273 aa  84.7  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.43 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2634  CRISPR-associated Cse3 family protein  31.82 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38182  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1389  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.85 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.68 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.61 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2338  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.57 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0932  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.31 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0829  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.03 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.85 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0764  CRISPR system CASCADE complex protein CasE  24.68 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0680361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  32.81 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.65 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  34.71 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3014  Cse3 family CRISPR-associated protein  32.19 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00083763  normal  0.0405409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2577  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.22 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0617652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1235  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.44 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100035  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.41 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.77 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.06 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3905  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.51 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  0.123474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2233  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.59 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.51 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.61 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0984  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.66 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2161  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.33 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0945  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.27 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417479  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.22 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0909  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.66 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2673  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.98 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1285  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.78 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.61 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1416  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.38 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.116754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13920  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0485  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.77 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.363464  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  21.83 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  20.99 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1588  CRISPR-associated Cse3 family protein  23.2 
 
 		 232 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0931  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.53 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.12 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>