50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0423 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0423  CRISPR-associated protein, Cse3 family  100 
 
 		 228 aa  447  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0256253  normal  0.0209563 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  45.74 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  45.29 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5410  CRISPR-associated protein, Cse3 family  44.74 
 
 		 243 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341034  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  33.48 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  37.1 
 
 		 220 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  38.35 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  38.84 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  33.99 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  38.39 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  38.39 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1603  CRISPR-associated protein, Cse3 family  36.18 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61218  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  39.81 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  38.22 
 
 		 216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  34.63 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  38.22 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  37.61 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2884  CRISPR-associated Cse3 family protein  38.05 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.542217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3093  crispr-associated protein, Cse3 family  29.1 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3543  CRISPR-associated Cse3 family protein  32.92 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410729  normal  0.0763733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  34.47 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3149  crispr-associated protein Cse3 family  29.1 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3586  CRISPR-associated protein, Cse3 family  34.56 
 
 		 215 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2475  CRISPR-associated protein, Cse3 family  37.96 
 
 		 292 aa  79  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2634  CRISPR-associated Cse3 family protein  33.01 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38182  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2988  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.44 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1235  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.55 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100035  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0961  hypothetical protein  31.88 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1389  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.51 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3014  Cse3 family CRISPR-associated protein  28.43 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00083763  normal  0.0405409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.58 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0829  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.84 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.27 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.59 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.59 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0932  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.59 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  29.49 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.38 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  41.67 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  42.86 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0909  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.25 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.87 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.76 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.21 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  48.78 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2161  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.54 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2673  CRISPR-associated protein, Cse3 family  38.33 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2577  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.81 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0617652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1285  CRISPR-associated protein, Cse3 family  38.81 
 
 		 239 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.36 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>