39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2475 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2475  CRISPR-associated protein, Cse3 family  100 
 
 		 292 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0961  hypothetical protein  50.67 
 
 		 299 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2988  CRISPR-associated Cse3 family protein  42.75 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  31.02 
 
 		 224 aa  123  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3149  crispr-associated protein Cse3 family  30.07 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3093  crispr-associated protein, Cse3 family  30.74 
 
 		 235 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3543  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.49 
 
 		 224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410729  normal  0.0763733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.47 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1603  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.99 
 
 		 225 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61218  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  27.61 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  27.03 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  27.03 
 
 		 216 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.5 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.7 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.7 
 
 		 216 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  42.86 
 
 		 215 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.73 
 
 		 220 aa  92.4  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5410  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.77 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341034  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.36 
 
 		 216 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3586  CRISPR-associated protein, Cse3 family  37.12 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  40.15 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0423  CRISPR-associated protein, Cse3 family  37.96 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0256253  normal  0.0209563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2884  CRISPR-associated Cse3 family protein  34.35 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.542217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.52 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  35.97 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  35.25 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  45.45 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  45.65 
 
 		 207 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  50 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0984  CRISPR-associated protein, Cse3 family  40.91 
 
 		 226 aa  46.2  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  33.33 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.76 
 
 		 215 aa  43.9  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  44.19 
 
 		 199 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  46.94 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  39.13 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  35.87 
 
 		 202 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  45.24 
 
 		 199 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  48.72 
 
 		 204 aa  42.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  32.26 
 
 		 229 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>