54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00870 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  100 
 
 		 222 aa  467  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3543  CRISPR-associated Cse3 family protein  53.15 
 
 		 224 aa  245  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410729  normal  0.0763733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  41.89 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  41.89 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  41.89 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  39.66 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  39.64 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  39.64 
 
 		 216 aa  162  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2884  CRISPR-associated Cse3 family protein  40.09 
 
 		 216 aa  161  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.542217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  39.19 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  37.95 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1603  CRISPR-associated protein, Cse3 family  39.81 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61218  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  35.47 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3586  CRISPR-associated protein, Cse3 family  34.27 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  34.76 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  35.19 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  34.33 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3149  crispr-associated protein Cse3 family  32.78 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3093  crispr-associated protein, Cse3 family  32.78 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0961  hypothetical protein  29.43 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2475  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.47 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5410  CRISPR-associated protein, Cse3 family  34.53 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341034  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0423  CRISPR-associated protein, Cse3 family  34.47 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0256253  normal  0.0209563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  32.04 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.81 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2988  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.08 
 
 		 273 aa  87.8  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0829  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.89 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.07 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0932  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.52 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.07 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2634  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.03 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.25 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1389  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.57 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1587  transcriptional regulator, Fis family protein  27.09 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3905  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.9 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  0.123474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.75 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.06 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.01 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2233  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3014  Cse3 family CRISPR-associated protein  27.42 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00083763  normal  0.0405409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  27.21 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.07 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1285  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.41 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.4 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2577  CRISPR-associated Cse3 family protein  23.3 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0617652 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0909  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.06 
 
 		 215 aa  45.1  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  20.85 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.24 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0485  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.86 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.363464  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.45 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1235  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.78 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100035  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.34 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0783  CRISPR-associated CT1974 family protein  22.5 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.230194  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2673  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.06 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>