58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3905 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3905  CRISPR-associated protein, Cse3 family  100 
 
 		 236 aa  488  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  0.123474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  58.72 
 
 		 229 aa  289  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1285  CRISPR-associated protein, Cse3 family  60.25 
 
 		 239 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  59.23 
 
 		 230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  56.4 
 
 		 207 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2577  CRISPR-associated Cse3 family protein  46.64 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0617652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  42.19 
 
 		 215 aa  175  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  35.51 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0022  hypothetical protein  35.56 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0984  CRISPR-associated protein, Cse3 family  36.71 
 
 		 226 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0764  CRISPR system CASCADE complex protein CasE  33.76 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0680361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.88 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1235  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.21 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100035  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3014  Cse3 family CRISPR-associated protein  28.39 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00083763  normal  0.0405409 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2634  CRISPR-associated Cse3 family protein  31.4 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2338  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.76 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.75 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.35 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.51 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.1 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  28.74 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.51 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.4 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.4 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  23.97 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.31 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5410  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.48 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1976  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.05 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.4 
 
 		 204 aa  62  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2884  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.71 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.542217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  30 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.21 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  23.81 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1389  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.37 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.74 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.41 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  23.51 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  23.11 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.9 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3093  crispr-associated protein, Cse3 family  26.51 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0945  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.7 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3149  crispr-associated protein Cse3 family  26.09 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1603  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.51 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61218  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.22 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1588  CRISPR-associated Cse3 family protein  37.74 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3543  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.31 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410729  normal  0.0763733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0909  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.83 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.63 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.27 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  22.64 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13920  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.62 
 
 		 197 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.475319 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0932  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17180  CRISPR-associated protein, Cse3 family  41.67 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0961  hypothetical protein  43.24 
 
 		 299 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.5 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1587  transcriptional regulator, Fis family protein  22.45 
 
 		 180 aa  42.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  43.9 
 
 		 220 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3586  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.77 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>