37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1588 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1588  CRISPR-associated Cse3 family protein  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1976  CRISPR-associated Cse3 family protein  40 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17180  CRISPR-associated protein, Cse3 family  42.58 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0945  CRISPR-associated protein, Cse3 family  38.22 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417479  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.49 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.32 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.63 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13920  CRISPR-associated protein, Cse3 family  33.33 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.63 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.82 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.92 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2988  CRISPR-associated Cse3 family protein  32.73 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.02 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1235  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.89 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100035  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  28.51 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.05 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1285  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.27 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3014  Cse3 family CRISPR-associated protein  26.32 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00083763  normal  0.0405409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.31 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  30.13 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.4 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0764  CRISPR system CASCADE complex protein CasE  24.23 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0680361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.96 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3905  CRISPR-associated protein, Cse3 family  37.74 
 
 		 236 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  0.123474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2338  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.2 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.27 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3093  crispr-associated protein, Cse3 family  22.22 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  22.63 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0961  hypothetical protein  28.42 
 
 		 299 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3149  crispr-associated protein Cse3 family  22.22 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2577  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.24 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0617652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  23.2 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3543  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.67 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410729  normal  0.0763733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  23.2 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0909  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.88 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0022  hypothetical protein  26.46 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0860  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.79 
 
 		 219 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>